Il possède deux rangées de plaques osseuses, une nageoire adipeuse et de très petites paires de barbillons. Son corps est argenté et traversé par une ligne longitudinale noire qui se rend du museau à la nageoire caudale. Cette ligne se termine en une tache noire sur la nageoire caudale. Une autre ligne noire va des nageoires ventrales jusqu'à la nageoire caudale. Le dessous du poisson est blanc. Les nageoires sont transparentes.
Les corydoras pygmaeus doivent être maintenus en groupe (6 est considéré comme le minimum pour des corydoras, mais vu la très grande timidité des pygmaeus, un nombre de 10 serait plus convenable). Cette espèce de corydoras, bien que se reposant sur le sol et fouillant le sable, nage souvent à mi-hauteur d\'eau, contrairement aux autres espèces de corydoras qui restent au sol.
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