Normalement, on ne met pas de charbon actif dans le filtre. Quand on doit utiliser un médicament, il ne faut pas non plus qu'il y ait de charbon. Quand le traitement est fini, on retire le médicament en faisant un changement d'eau de 25 à 40% (selon la posologie) et en filtrant sur charbon pendant environ 48 heures. Puis, on jette le charbon.