Comme l'a dit Astro c'est probablement du à un champignon, j'ai eu la même chose dans un bac avec une racine qui avait bien été bouillie, c'est n'est pas du tout grave et cela devrait rester sur la racine uniquement.
Dans mon bac c'est parti quelques jours après l'introduction de crevettes ;)
Le marron sur les feuilles c'est sans doute des algues, c'est normal dans un nouveau bac pas encore équilibré et cela devrait partir assez facilement si tu frottes doucement les feuilles avec tes doigts ;)
Pour les fils sur la cabomba ce sont des racines "aériennes", c'est normal et tu peux les laisser ;)
Bref tout va bien quoi :)