Pas d'affolement, y'a rien de dramatique.
Pour le substrat tu n'est pas obliger d'en mettre et donc de tout recommencer, il y a des boulettes a base d'argile qui s'achète (ou qu'on peux faire soit même) qui ce place au pied des plantes dans le sable, sa donne de très bon résultat.
Pour ton filtre faudrait rajouter des nouilles en céramique pour le support bactériologique, plus de la ouate, sa ira bien comme ça.
Pour les plantes au vu de l'éclairage faudra opter pour des plantes peu gourmande en lumière, Roxa ta donner quelques exemple, il y a la Vallisnéria aussi.
Pour la racine maintenant qu'elle est dans le bac, je sais pas si ça changera grand chose de la faire bouillir.